Seit einigen Jahren ist am Fledermaustor, welches die in der Sontheimer Höhle überwinternden Fledermäuse vor Störungen schützt, eine Lichtschranke installiert. Ein- und Ausflüge der Fledermäuse werden registriert und mittels Statistiken ausgewertet.
Bei visuellen Zählungen wurden in den letzten Jahren ca. 400 überwinternde Fledermäuse gezählt. Durch die Zählung mit der Lichtschranke wissen wir, dass allein hinter dem Fledermaustor ca. 1000 Fledermäuse ihr Winterquartier in der Sontheimer Höhle haben, es gibt aber noch weitere Orte in der Höhle, an denen die Fledermäuse überwintern.